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质粒小量提取试剂盒常见问题与解析

更新:2023年02月22日 17:35 好一点

好一点小编带来了质粒小量提取试剂盒常见问题与解析,希望能对大家有所帮助,一起来看看吧!
质粒小量提取试剂盒常见问题与解析

质粒小量提取试剂盒常见从1~4mL菌液可以抽提到5~30µg的质粒,纯度高,OD260/OD280比值一般为1.8-2.0之间,质粒可直接用于PCR、酶切、转化测序和体外转录等后续实验。那么在实验过程中常见问题有哪些,下面跟我一起来看一下。
质粒小量提取试剂盒质粒得率低可能原因及解决办法:

1、菌体未活化,生长效率低,菌量少。需要活化菌种。

2、属于低拷贝质粒,增加菌液的量。

3、SolutionB裂解不充分,室温静置5min。

4、最后洗脱体积不够,洗脱液不少于50µL。

质粒小量提取试剂盒质粒纯度差可能原因:

1、SolutionA未加入RNaseA或加入RNaseA的SolutionA 未4℃保存。

2、加入SolutionB剧烈震荡,使得基因组断裂。

3、加入BufferN操作慢,形成微小沉淀,蛋白质无法被充分漂洗干净。

4、BufferW2未加入无水乙醇。

5、OD260/OD280比值一般在1.8-2.0之间,小于1.8可能有蛋白污染,大于2.0有部分降解或RNA污染。

质粒提取试剂盒是采用碱裂解法裂解细胞,通过吸附柱在高盐状态下特异性地结合溶液中的DNA的特性提取质粒DNA。提取的质粒DNA可适用于各种常规的分子生物学试验,包括酶切、PCR、测序、连接和转化等试验。并不是医疗器械。

p1:葡萄糖使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA是Ca²⁺和Mg²⁺等二价金属离子的螯合剂,其主要目的是为了螯合二价金属离子从而达到抑制DNase的活性;可添加RNase A消化RNA。

p2:此步为碱处理。其中NaOH主要是为了溶解细胞,释放DNA,因为在强碱性的情况下,细胞膜发生了从双层膜结构向微囊结构的变化。SDS与NaOH联用,其目的是为了增强NaOH的强碱性,同时SDS作为阴离子表面活性剂破坏脂双层膜。

p3:溶液III的作用是沉淀蛋白和中和反应。其中醋酸钾是为了使钾离子置换SDS中的钠离子而形成了PDS,因为十二烷基硫酸钠遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾 ,而PDS是不溶水的,同时一个SDS分子平均结合两个氨基酸,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了。

2M的醋酸是为了中和NaOH。基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100 kb大小的片断,就没有办法再被 PDS共沉淀了,所以碱处理的时间要短,而且不得激烈振荡,不然最后得到的质粒上总会有大量的基因组DNA混入,琼脂糖电泳可以观察到一条浓浓的总DNA条带。

75%酒精主要是为了清洗盐份和抑制Dnase;同时溶液III的强酸性也是为了使DNA更好地结合在硅酸纤维膜上。



扩展资料

质粒具有自主复制能力,使其在子代细胞中也能保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。细菌质粒为DNA重组技术中常用的载体。载体,把一个有用的外源基因通过基因工程手段,送进受体细胞中去进行增殖和表达的工具。

将某种目标基因片段重组到质粒中,构成重组基因或重组体。然后将这种重组体经微生物学的转化技术,转入受体细胞(如大肠杆菌)中,使重组体中的目标基因在受体菌中得以繁殖或表达,从而改变寄主细胞原有的性状或产生新的物质。

参考资料来源:百度百科-质粒

参考资料来源:百度百科-质粒抽提

质粒提取试剂盒一般包括:质粒小量提取试剂盒(离心柱型)、质粒大量提取试剂盒(离心柱型)、无内毒素质粒小量提取试剂盒(离心柱型)、96板高纯质粒DNA小提试剂盒。
选择好的质粒提取试剂盒很重要,有时我们测序时测不出来,总是怀疑是测序公司的问题,其实这跟试剂盒有很大的关系,根据自己多年测序经验来说北京三博远志SUNBIOTECH质粒提取试剂盒很不错,测序成功率很高,比一般国产试剂盒高出12%。长度长100-300bp进口膜,建议您去试试。

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